พวกลิโกะได้ยินว่ามีโปเกมอนเกิดอาการไม่ได้ขึ้นในป่าเพิ่มขึ้นหลายตัว จึงออกไปตรวจสอบว่าเป็นผลจากลาควาเรียมใช่หรือไหม แล้วได้เจอมอลลีที่กำลังรักษาโปเกมอนป่าที่โดนพิษ! ขณะกำลังดีใจที่ได้พบมอลลีซึ่งตอนนี้ทำงานที่โปเกมอนเซ็นเตอร์ ก็ได้ยินเสียงหวาดกลัวของเหล่าโปเกมอนดังขึ้นจากในป่าลึก...! ปลายทางที่ไปถึงมีรัฟเฟรเซียที่อาละวาดปล่อยพิษกระจายอยู่...!?
